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本部分设定了隐藏,您已回复过了,以下是隐藏的内容 Y`q!V= 目前已有多种方法可用于SNP检测,如根据DNA列阵的微测序法、动态等位基因特异的杂交、寡聚核苷酸特异的连接、DNA芯片以及TaqMan系统等。但不管哪一种方法,首先必须进行靶序列的扩增,然后才能进行其它检测。 Es:5yX! 传统的SNP检测方法是采用一些已有的成熟技术,如DNA测序、限制性酶切片段长度多态性(RFLP)、单链构象多态性(SSCP)、等位基因特异的寡聚核苷酸杂交(ASO)等。这些技术虽在某种程度上能完成对 SNP的检测,但由于它们必须通过凝胶电泳进行检测,因此,距快速、高效、自动化的目标还相差甚远。传统的RFLP只能检测到SNP的一部分,测序技术既费时费力,又不易实现自动化,而且DNA链的二级结构还容易造成人工假相,使测序结果出现偏差,不适宜于SNP的检测;SSCP则很难满足自动化的需要,难以大规模开展工作。因此,这些方法均未被广泛采用。 H!#5!m& DNA芯片技术是近年来新开发的一种DNA序列变异检测工具。DNA芯片(DNAchip),也称生物芯片(biochip),其大小与计算机上的CPU芯片相似,约1 cm2或更大些,以玻璃、硅、聚丙烯等作为载体基片,芯片上铺了一层肉眼看不见的DNA纤维“地毯”,即具有特定碱基序列的探针。待测基因经提取后,被切成长短不一的片段,经荧光化学物质标记后,注射到嵌有芯片的载片上。由于DNA和探针杂交的程度与荧光强度相关,因此通过激光扫描,即可根据荧光强弱测出被检测序列的变异。 bsMC#xT 目前已有多家公司开展了对芯片的研究,例如美国的Affymetrix公司、NEN生命科学公司等。前者曾开发出BRCA1(乳癌基因1号)芯片、 p53芯片等,后者则在1张玻璃芯片上集成了多达2400个已知基因。此外,Research Genetics公司新近开发了1个集成有1500个SNP的DNA芯片,它涵盖了人类基因组全部24条染色体,所提供的信息量至少等于或优于目前常用的300~400个微卫星标记的图谱,检测时只需0.5μg的DNA样品就可进行1次全基因组的扫描。 k=FcPF" 另外Transgenomic公司的WAVE®核苷酸片段分析系统是高通量且较为准确可靠的筛查未知、已知SNP的新方法。利用Transgenomic公司的WAVE®核苷酸片段分析系统进行SNP检测平均每个样本的费用为$0.5。 x6jm-n FfjC
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